قصة الفيلم
لا يزال الضابطان جودي هوبس ونيك وايلد يكافحان من أجل أن يُؤخذا على محمل الجد كمحققين، وهو صراع يزداد سوءًا عندما يتحول تحقيقهما السري في قضية تهريب إلى كارثة عامة. ومع تهديد رئيس الشرطة بوغو بتفريقهما، يلاحق الاثنان خيطًا أخيرًا: ثعبان غامض شوهد بالقرب من مسرح الجريمة. يقودهما هذا الخيط إلى غاري دي سنيك، وهو هارب من أفاعي الحفرة مهووس بكشف سر وراء جدران التحكم في مناخ المدينة. عندما تدرك جودي ونيك أنه يقول الحقيقة، يتم تلفيق التهمة لهما فجأة من قبل عائلة لينكسلي القوية، التي دفعت جرائمها المدفونة زواحف زوتوبيا إلى العيش تحت الأرض، وخططها الجديدة أكثر شرًا بكثير. بعد أن أصبحا هاربين، ينضم جودي ونيك إلى نيبلز مابلستيك، وهو قندس غريب الأطوار مهووس بنظريات المؤامرة، لتعقب غاري وكشف الظلم الذي نشأ في المدينة، وهي قضية ستختبر شراكتهما، وتقلب كل ما ظنّا أنهما يعرفانه عن زوتوبيا، وتقلب علاقات الصداقة والعداء رأسًا على عقب.